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免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)實(shí)驗(yàn)
更新時(shí)間:2024-07-26
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廠商性質(zhì):其他
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)實(shí)驗(yàn)
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)實(shí)驗(yàn)流程:
樣品準(zhǔn)備
將不同分組的細(xì)胞從培養(yǎng)箱中取出(每組2個(gè)10cm的皿),在冰上用預(yù)冷的PBS洗一遍,加入裂解液(20mM Tris-HCL Ph7.5、150 mM Nacl、1%TritonX-100、1 mM EDTA和蛋白酶抑制劑),用細(xì)胞刮裂解細(xì)胞。13000rpm 4℃離心10min,去上清進(jìn)行蛋白定量。定量后原液備用。
蛋白定量
1 標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制:取一塊酶標(biāo)板,按照下表加入試劑
孔號(hào) | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
蛋白標(biāo)準(zhǔn)液(μl) | 0 | 2 | 4 | 6 | 8 | 12 | 16 | 20 |
去離子水(μl) | 20 | 18 | 16 | 14 | 12 | 8 | 4 | 0 |
蛋白濃度(μg/μl) | 0 | 0.05 | 0.1 | 0.15 | 0.2 | 0.3 | 0.4 | 0.5 |
2. 根據(jù)樣品數(shù)量,將BCA試劑A與試劑B按體積比為50:1配制適量BCA工作液,充分混勻;
3. 各孔加入160μl BCA工作液;
4. 把酶標(biāo)板放在振蕩器上振蕩30sec,37℃放置30分鐘,然后在562nm下測(cè)定吸光度。以吸光值為橫坐標(biāo),蛋白濃度(μg/μl)為縱坐標(biāo),繪出標(biāo)準(zhǔn)曲線;
5. 在酶標(biāo)板中加入2μl待測(cè)蛋白和18μl PBS(稀釋10倍),加入160μl BCA工作液,把酶標(biāo)板放在振蕩器上振蕩30sec,37℃放置30分鐘,然后在562nm下測(cè)定吸光度。
6. 根據(jù)所測(cè)樣品的吸光值,在標(biāo)準(zhǔn)曲線上即可查得相應(yīng)的蛋白濃度(μg/μl),乘以樣品稀釋倍數(shù)(10)即為樣品實(shí)際濃度(單位:μg /μl)。
共沉淀
根據(jù)蛋白定量結(jié)果,將各組蛋白留取適量用于做input對(duì)照;
分別取各組細(xì)胞蛋白置于2個(gè)1.5ml離心管中(2mg每管),其中一個(gè)加入2ug IgG,另外一個(gè)加入2ug IP指標(biāo)對(duì)應(yīng)的抗體,冰上孵育2h;
分別向兩個(gè)管子中加入protein G-Agarose beads(Roche),加裂解液至1ml。4℃旋轉(zhuǎn)混勻,孵育過(guò)夜;
2500rpm,4℃離心1min,去上清,1ml裂解液洗滌沉淀4次;
加入2×蛋白上樣緩沖液,輕輕混勻后煮沸5min,2500rpm離心1min,棄沉淀;
將上清轉(zhuǎn)移至新的離心管中,用于western blot檢測(cè)相應(yīng)蛋白。
PAGE膠的制備
1. 下層分離膠的制備
根據(jù)目的蛋白的分子量選擇不同的凝膠濃度,高分子量蛋白用低濃度膠,低分子量蛋白用高濃度膠分離。 GRα 90kDa AP-1 43.48kDa IkB 39kDa STAT3 79, 86kDa NF-KB p65 故選用10%的膠。不同濃度的分離膠按下表進(jìn)行配制,待下層膠凝固后進(jìn)行上次濃縮膠的配制。
2. 上層濃縮膠的配制
根據(jù)需要按下表配制濃縮膠,并插好梳子。
上樣及電泳
1. 上樣
每孔上樣量約為20ul蛋白,可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)要求加大上樣量。將配制好的PAGE膠放入電泳槽中,加入適量電泳緩沖液,取下梳子用槍輕輕吹打加樣孔,避免孔內(nèi)有余膠殘留影響上樣。將準(zhǔn)備好的樣品用加樣槍慢慢加到對(duì)應(yīng)的孔內(nèi),注意勿溢出加樣孔。
2. 電泳
一般濃縮膠80V 20分鐘,分離膠120V 60分鐘,可以根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)要求調(diào)整電壓和時(shí)間。當(dāng)染料到達(dá)膠底部時(shí)切斷電源,停止電泳,進(jìn)行下一步轉(zhuǎn)膜。
轉(zhuǎn)膜
轉(zhuǎn)膜分為濕轉(zhuǎn)和半干轉(zhuǎn),本實(shí)驗(yàn)室選用半干轉(zhuǎn)。
半干式轉(zhuǎn)膜中,三明治的排列為:/慮紙/膠/膜/慮紙,用電轉(zhuǎn)緩沖液浸濕后,直接置于電轉(zhuǎn)儀的正負(fù)極之間。膠于負(fù)極而膜置于正極。半干式的電轉(zhuǎn)緩沖液不同于濕式的電轉(zhuǎn)緩沖液,推薦為:48 mM Tris, 39 mM glycine, 0.04% SDS, 20%甲醇。25V轉(zhuǎn)膜30分鐘即可。轉(zhuǎn)膜前將PVDF膜在甲醇中浸泡1-2 分鐘(NC膜在電轉(zhuǎn)液中浸泡10-20分鐘),再孵育于冰冷的電轉(zhuǎn)緩沖液中5 分鐘,膠也需在冰冷的電轉(zhuǎn)緩沖液中平衡3-5 分鐘,否則轉(zhuǎn)膜時(shí)會(huì)導(dǎo)致條帶變形。
膜上蛋白的檢測(cè)
為檢測(cè)轉(zhuǎn)膜是否成功,可用麗春紅染色,麗春紅染色工作液:2%的麗春紅貯備液1:10 稀釋,即加9 倍的ddH2O
染色方法:將膜放入TBST 洗一次,再置于麗春紅染色工作液中,在室溫下?lián)u動(dòng)染色5 分鐘,大量的水洗膜直至水變清無(wú)色蛋白條帶清晰,(膜也可以用TBST 或水重新洗后再進(jìn)行染色)PVDF 膜需用甲醇再活化后用TBST洗后進(jìn)行封閉。
膜的封閉及抗體孵育
1. 封閉:5%脫脂奶粉(檢測(cè)磷酸化蛋白用BSA)室溫封閉1小時(shí)或4℃過(guò)夜。
2. 一抗:根據(jù)說(shuō)明書(shū)GRα 1:800 AP-1 1:1000 IkB 1:1000 STAT3 1:1000 NF-KB 1:1000 稀釋抗體,抗體加入封閉液中稀釋到所需濃度,和膜室溫孵育2小時(shí)或4 ℃孵育過(guò)夜。
3. 二抗:孵育一抗的膜用TBST洗滌3次,每次5min。隨后根據(jù)用量,按照1:1000稀釋HRP標(biāo)記的二抗,與膜37℃孵育1h。用TBST洗滌3次,每次5min。
顯色
ECL化學(xué)發(fā)光檢測(cè):配制ECL發(fā)光液,根據(jù)用量,取ECL發(fā)光液A和B等量混勻,加在膜的正面暗室避光5分鐘。倒掉顯色液,用紙小心吸取顯色液,在上面蓋上一層平整的透明紙。將其放入成像系統(tǒng)中進(jìn)行掃描??梢愿鶕?jù)條帶強(qiáng)弱再次感光或減短感光時(shí)間已達(dá)到理想結(jié)果。